Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms