Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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