Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms