Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
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NischQ80TM9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
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