Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms