Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms