Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sbno2Q7TNB8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sbno2Q7TNB8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms