Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Shq1Q7TMX5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Shq1Q7TMX5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Shq1Q7TMX5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Shq1Q7TMX5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Shq1Q7TMX5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Shq1Q7TMX5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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