Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms