Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox11Q7M6Y2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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