Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssxb10Q6XAR7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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