Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms