Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trak1Q6PD31 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms