Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6PD19 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6PD19 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6PD19 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6PD19 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6PD19 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms