Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms