Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms