Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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