Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mvb12bQ6KAU4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mvb12bQ6KAU4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms