Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms