Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms