Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms