Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms