Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms