Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spty2d1Q68FG3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spty2d1Q68FG3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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