Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf280dQ68FE8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms