Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Ccdc18Q640L5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc18Q640L5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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