Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms