Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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