Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm5dQ62240 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm5dQ62240 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms