Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema4aQ62178 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms