Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms