Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ift88Q61371 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ift88Q61371 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift88Q61371 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift88Q61371 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift88Q61371 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift88Q61371 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ift88Q61371 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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