Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Foxd1Q61345 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd1Q61345 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms