Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms