Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cln3Q61124 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cln3Q61124 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms