Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurod1Q60867 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurod1Q60867 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms