Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cnot7Q60809 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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