Protein–RNA interactions for Protein: Q60775

Elf1, ETS-related transcription factor Elf-1, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf1Q60775 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elf1Q60775 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elf1Q60775 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms