Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atf3Q60765 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atf3Q60765 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms