Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk2a1Q60737 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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