Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms