Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Akap4Q60662 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Akap4Q60662 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms