Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms