Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms