Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf12Q5SPL2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms