Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85aQ5SP85 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms