Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim41Q5NCC3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms