Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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