Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnl1Q52KE7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnl1Q52KE7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms