Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lin28bQ45KJ6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lin28bQ45KJ6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms